Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms