Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms