Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms