Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms