Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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