Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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C15orf40Q8WUR7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf40Q8WUR7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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