Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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