Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL34Q8N239 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL34Q8N239 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms