Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOT1Q8IXI2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms