Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms