Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE4Q6UWF7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms