Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms