Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms