Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM69BQ5VUD6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms