Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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