Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms