Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms