Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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