Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms