Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM16Q2WEN9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM16Q2WEN9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms