Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms