Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP1R3AQ16821 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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