Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms