Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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