Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLFQ16534 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLFQ16534 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLFQ16534 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLFQ16534 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLFQ16534 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms