Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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