Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PMCHL1Q16048 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms