Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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