Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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