Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SS18Q15532 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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SS18Q15532 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SS18Q15532 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SS18Q15532 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SS18Q15532 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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