Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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CYTH1Q15438 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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