Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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