Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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