Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNIP1Q15025 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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