Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CHD4Q14839 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CHD4Q14839 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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