Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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