Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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