Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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