Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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