Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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