Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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