Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL3Q13618 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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