Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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