Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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