Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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