Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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