Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms