Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLEQ07864 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLEQ07864 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLEQ07864 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms