Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms