Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LTBQ06643 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LTBQ06643 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBQ06643 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBQ06643 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms